Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms