Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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