Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Trmt44Q9D2Q2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trmt44Q9D2Q2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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