Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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