Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms