Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl28Q9D1B9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl28Q9D1B9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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