Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Elp3Q9CZX0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Elp3Q9CZX0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms