Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Malsu1Q9CWV0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms