Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cnot11Q9CWN7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cnot11Q9CWN7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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