Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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