Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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