Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms