Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkp2Q9CQ73 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms