Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms