Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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