Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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Chmp3Q9CQ10 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chmp3Q9CQ10 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chmp3Q9CQ10 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Chmp3Q9CQ10 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms