Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssxb1Q9CPU1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssxb1Q9CPU1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb1Q9CPU1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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