Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf8Q99PV0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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