Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ms4a6dQ99N07 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a6dQ99N07 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a6dQ99N07 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a6dQ99N07 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a6dQ99N07 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a6dQ99N07 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a6dQ99N07 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a6dQ99N07 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a6dQ99N07 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a6dQ99N07 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ms4a6dQ99N07 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms