Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms