Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gdpd3Q99LY2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gdpd3Q99LY2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms