Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ciao1Q99KN2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms