Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms