Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms