Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc1bQ920F6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Smc1bQ920F6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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