Protein–RNA interactions for Protein: Q91YT2

Rnf185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf185Q91YT2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf185Q91YT2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms