Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VDP2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8VDP2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms