Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ttc8Q8VD72 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ttc8Q8VD72 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ttc8Q8VD72 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ttc8Q8VD72 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ttc8Q8VD72 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ttc8Q8VD72 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Ttc8Q8VD72 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ttc8Q8VD72 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc8Q8VD72 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms