Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms