Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk8Q8R3L8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms