Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Colec12Q8K4Q8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Colec12Q8K4Q8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Colec12Q8K4Q8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Colec12Q8K4Q8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Colec12Q8K4Q8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Colec12Q8K4Q8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms