Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lrrtm1Q8K377 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lrrtm1Q8K377 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lrrtm1Q8K377 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lrrtm1Q8K377 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lrrtm1Q8K377 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lrrtm1Q8K377 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lrrtm1Q8K377 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lrrtm1Q8K377 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lrrtm1Q8K377 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Lrrtm1Q8K377 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm1Q8K377 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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