Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek9Q8K1R7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms