Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn3Q8K045 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms