Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGW4

Sox30, Transcription factor SOX-30, mousemouse

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Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox30Q8CGW4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox30Q8CGW4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sox30Q8CGW4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox30Q8CGW4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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