Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hpf1Q8CFE2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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