Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms