Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc178Q8CDV0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc178Q8CDV0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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