Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc38Q8CDN8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc38Q8CDN8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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