Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfibp1Q8C8U0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms