Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnma1Q8C1C8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnma1Q8C1C8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms