Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Atg16l1Q8C0J2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Atg16l1Q8C0J2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Atg16l1Q8C0J2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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