Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim35Q8C006 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim35Q8C006 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim35Q8C006 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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