Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp38Q8BW70 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp38Q8BW70 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp38Q8BW70 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp38Q8BW70 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp38Q8BW70 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp38Q8BW70 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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