Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcl3Q8BVF2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pdcl3Q8BVF2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pdcl3Q8BVF2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pdcl3Q8BVF2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pdcl3Q8BVF2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pdcl3Q8BVF2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcl3Q8BVF2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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