Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Me3Q8BMF3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms