Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ubash3bQ8BGG7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ubash3bQ8BGG7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ubash3bQ8BGG7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ubash3bQ8BGG7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ubash3bQ8BGG7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ubash3bQ8BGG7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ubash3bQ8BGG7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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