Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Htatsf1Q8BGC0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Htatsf1Q8BGC0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Htatsf1Q8BGC0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Htatsf1Q8BGC0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htatsf1Q8BGC0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Htatsf1Q8BGC0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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