Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cracr2bQ80ZJ8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms