Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms